醫藥化工行業廢水由于處理難度大，一直以來都是環保治理工作的重點之一。醫藥化工廢水處理方法也有很多，而隨著科技的發展，如何提高對這類工業廢水處理的效率成為新的挑戰。 醫藥化工廢水成分復雜，且富含高濃度氨氮、硫酸鹽、SS以及難生物降解和有毒有害的有機物的特性，因此可先通過調節池和混凝氣浮機對廢水進行調節并氣浮絮凝沉淀處理以去除廢水中SS及部分氨氮、COD，以確保后續系統反應穩定運行。隨后醫藥化工廢水進入臭氧接觸氧化塔進行臭氧協同雙氧水氧化處理，將廢水中復雜的大分子有機物氧化成可生物降解的小分子有機物以提高廢水的可生化性，并可將氨氮氧化分解為氮氣和水，同時臭氧協同雙氧水氧化廢水中難生物降解的有機物的末端產物為二氧化碳、水及其他礦物質，沒有二次污染，且降解速度相對單一氧化過程具有顯著提高。之后依次通過水解酸化池和厭氧反應器進行水解酸化、厭氧生物接觸，利用兩類獨立菌群以及兩類菌群的前后協同作用，可有效提高廢水中硫酸鹽、氨氮及COD的去除率，使醫化工廢水達到可生化性的目的，降低廢水的毒性，避免對環境造成污染，同時于厭氧生物接觸過程中產生的沼氣可回收再利用，增加生產附加值。這種醫藥化工廢水處理方法有效提高對廢水的處理效率，減少對環境的污染。
制藥行業屬于精細化工,制藥工業廢水主要包括抗生素生產廢水、合成藥物生產廢水、中成藥生產廢水以及各類制劑生產過程的洗滌水和沖洗廢水四大類。其廢水的特點是成分復雜、有機物含量高、毒性大、色度深和含鹽量高，特別是生化性很差，且間歇排放,比其他有機廢水處理更難處理。
制藥廢水處理工藝：
制藥廢水的處理方法可歸納為以下幾種：物化處理、化學處理、生化處理以及多種方法的組合處理等，各種處理方法具有各自的優勢及不足。由于制藥行業原料及工藝的多樣性，排放的廢水水質千差萬別，所以制藥廢水并沒有成熟統一的治理方法，具體選擇哪種工藝路線取決于廢水的性質。根據該廢水的特點，一般應通過預處理以提高廢水的可生化性并初步去除污染物，再結合生化處理。
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